Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BAP07359 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP1BAP07359 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP1BAP07359 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP1BAP07359 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms