Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSF1RP07333 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSF1RP07333 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSF1RP07333 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms