Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLBP06746 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLBP06746 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLBP06746 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLBP06746 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLBP06746 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLBP06746 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLBP06746 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLBP06746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLBP06746 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLBP06746 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLBP06746 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLBP06746 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLBP06746 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLBP06746 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLBP06746 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLBP06746 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLBP06746 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLBP06746 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLBP06746 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLBP06746 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLBP06746 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLBP06746 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLBP06746 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLBP06746 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLBP06746 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POLBP06746 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLBP06746 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLBP06746 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
POLBP06746 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLBP06746 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLBP06746 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLBP06746 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLBP06746 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLBP06746 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLBP06746 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLBP06746 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLBP06746 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLBP06746 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLBP06746 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLBP06746 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLBP06746 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLBP06746 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLBP06746 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLBP06746 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLBP06746 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLBP06746 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms