Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THY1P04216 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THY1P04216 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THY1P04216 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THY1P04216 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THY1P04216 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THY1P04216 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THY1P04216 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THY1P04216 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THY1P04216 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THY1P04216 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THY1P04216 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THY1P04216 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
THY1P04216 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THY1P04216 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THY1P04216 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THY1P04216 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THY1P04216 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THY1P04216 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THY1P04216 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THY1P04216 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THY1P04216 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THY1P04216 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THY1P04216 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THY1P04216 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THY1P04216 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THY1P04216 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms