Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC4A1P02730 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A1P02730 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms