Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHG1P01857 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHG1P01857 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHG1P01857 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG1P01857 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHG1P01857 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHG1P01857 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG1P01857 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG1P01857 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGHG1P01857 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG1P01857 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHG1P01857 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHG1P01857 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG1P01857 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG1P01857 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG1P01857 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHG1P01857 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHG1P01857 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHG1P01857 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms