Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP4O95707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP4O95707 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP4O95707 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP4O95707 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP4O95707 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP4O95707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP4O95707 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP4O95707 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP4O95707 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP4O95707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP4O95707 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP4O95707 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP4O95707 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP4O95707 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP4O95707 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP4O95707 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP4O95707 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POP4O95707 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP4O95707 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP4O95707 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP4O95707 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POP4O95707 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP4O95707 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP4O95707 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP4O95707 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POP4O95707 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POP4O95707 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POP4O95707 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP4O95707 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POP4O95707 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POP4O95707 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP4O95707 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP4O95707 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POP4O95707 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP4O95707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POP4O95707 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP4O95707 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP4O95707 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP4O95707 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP4O95707 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP4O95707 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POP4O95707 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms