Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFAIP8O95379 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFAIP8O95379 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFAIP8O95379 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms