Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBL3O95164 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBL3O95164 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL3O95164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL3O95164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL3O95164 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBL3O95164 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBL3O95164 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBL3O95164 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBL3O95164 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBL3O95164 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL3O95164 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL3O95164 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL3O95164 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBL3O95164 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBL3O95164 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBL3O95164 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBL3O95164 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBL3O95164 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBL3O95164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBL3O95164 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBL3O95164 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBL3O95164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBL3O95164 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBL3O95164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBL3O95164 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms