Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDKL5O76039 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDKL5O76039 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDKL5O76039 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms