Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT34O76011 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT34O76011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT34O76011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT34O76011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT34O76011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT34O76011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT34O76011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT34O76011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT34O76011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT34O76011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT34O76011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT34O76011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT34O76011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT34O76011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT34O76011 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT34O76011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT34O76011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT34O76011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT34O76011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT34O76011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT34O76011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT34O76011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT34O76011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT34O76011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT34O76011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT34O76011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms