Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN15O75808 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN15O75808 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN15O75808 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms