Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALMO75781 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALMO75781 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALMO75781 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALMO75781 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALMO75781 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALMO75781 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALMO75781 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALMO75781 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALMO75781 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALMO75781 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALMO75781 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALMO75781 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALMO75781 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PALMO75781 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALMO75781 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALMO75781 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMO75781 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMO75781 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMO75781 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMO75781 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALMO75781 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALMO75781 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALMO75781 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALMO75781 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms