Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKRAO75569 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKRAO75569 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms