Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 07e-22■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 313.11□□□□□ -0.312e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-202ENST00000509700 870 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 DIRC3-204ENST00000486365 2582 ntTSL 510.78□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-203ENST00000636689 1184 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-210ENST00000640914 565 ntTSL 59.04□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 RALGAPA2-203ENST00000427175 2623 ntTSL 28.96□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-209ENST00000640017 2968 ntTSL 28.94□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-206ENST00000638840 3260 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 PAFAH1B1-213ENST00000610190 650 ntTSL 25.65□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 51.5
DKC1O60832 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 215.58■□□□□ 0.089e-9■■■■■ 51.4
DKC1O60832 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 51.4
DKC1O60832 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.96□□□□□ -1.141e-323■■■■■ 51.3
DKC1O60832 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.73■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 51.3
DKC1O60832 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 520.85■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 51.3
DKC1O60832 TAF1D-219ENST00000534079 656 ntTSL 24.08□□□□□ -1.761e-323■■■■■ 51.2
DKC1O60832 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 519.76■□□□□ 0.751e-323■■■■■ 51.2
DKC1O60832 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 33.97□□□□□ -1.771e-323■■■■■ 51.2
DKC1O60832 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 51.2
DKC1O60832 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-18■■■■■ 51.1
DKC1O60832 FREM1-206ENST00000466679 741 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-323■■■■■ 51.1
DKC1O60832 FREM1-209ENST00000497634 701 ntTSL 31.61□□□□□ -2.151e-323■■■■■ 51.1
DKC1O60832 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 313.47□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 51
DKC1O60832 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-13■■■■■ 51
DKC1O60832 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-13■■■■■ 51
DKC1O60832 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-13■■■■■ 51
DKC1O60832 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-13■■■■■ 51
DKC1O60832 SRC-209ENST00000489153 551 ntTSL 36.02□□□□□ -1.454e-13■■■■■ 51
DKC1O60832 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 50.9
DKC1O60832 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 50.9
DKC1O60832 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 50.9
DKC1O60832 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 50.9
DKC1O60832 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 50.9
DKC1O60832 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 50.9
DKC1O60832 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 50.9
DKC1O60832 MED27-203ENST00000444872 433 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 50.6
DKC1O60832 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 50.6
DKC1O60832 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 50.6
DKC1O60832 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 50.5
DKC1O60832 SARDH-206ENST00000427237 1957 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 50.5
DKC1O60832 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.48□□□□□ -1.853e-10■■■■■ 50.5
DKC1O60832 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-21■■■■■ 50.4
DKC1O60832 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.87■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.65■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 50.4
DKC1O60832 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 50.3
DKC1O60832 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC8.49□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 50.3
DKC1O60832 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.156e-9■■■■■ 50.3
DKC1O60832 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.276e-9■■■■■ 50.3
DKC1O60832 SERPINB1-203ENST00000468511 449 ntTSL 36.89□□□□□ -1.316e-9■■■■■ 50.3
DKC1O60832 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.141e-323■■■■■ 50.3
DKC1O60832 NOP56-214ENST00000484998 998 ntTSL 58.61□□□□□ -1.036e-15■■■■■ 50.3
DKC1O60832 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 50.2
DKC1O60832 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 50.2
DKC1O60832 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 50.1
DKC1O60832 SNHG3-203ENST00000447507 185 ntTSL 1 (best)0.28□□□□□ -2.361e-323■■■■■ 50.1
DKC1O60832 DOCK1-204ENST00000484400 779 ntTSL 39.02□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 50.1
DKC1O60832 DOCK1-202ENST00000464466 323 ntTSL 37.83□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 50.1
DKC1O60832 BRD9-210ENST00000493082 750 ntTSL 514.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 50
DKC1O60832 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 218.23■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 218.22■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 37.23□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 49.9
DKC1O60832 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 49.8
DKC1O60832 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 317.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 49.8
DKC1O60832 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 49.8
DKC1O60832 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 49.8
DKC1O60832 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 59.63□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 49.8
DKC1O60832 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 223.39■■□□□ 1.331e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 214.82□□□□□ -0.041e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 413.67□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.751e-323■■■■■ 49.8
DKC1O60832 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-10■■■■■ 49.8
DKC1O60832 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 49.8
DKC1O60832 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 49.8
DKC1O60832 ZNF487-204ENST00000456416 567 ntTSL 419.92■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 49.5
DKC1O60832 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-9■■■■■ 49.5
DKC1O60832 ZNF487-201ENST00000315429 568 ntAPPRIS P1 TSL 217.09■□□□□ 0.331e-9■■■■■ 49.5
DKC1O60832 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC9.3□□□□□ -0.921e-323■■■■■ 49.5
DKC1O60832 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 49.4
DKC1O60832 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 49.4
DKC1O60832 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 49.4
DKC1O60832 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 426.63■■□□□ 1.857e-9■■■■■ 49.4
DKC1O60832 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.716e-11■■■■■ 49.4
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