Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD1O60671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD1O60671 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD1O60671 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD1O60671 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD1O60671 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD1O60671 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD1O60671 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD1O60671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD1O60671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD1O60671 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD1O60671 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD1O60671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD1O60671 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD1O60671 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD1O60671 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD1O60671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD1O60671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD1O60671 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD1O60671 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD1O60671 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD1O60671 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD1O60671 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD1O60671 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD1O60671 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD1O60671 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD1O60671 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD1O60671 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD1O60671 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD1O60671 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD1O60671 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD1O60671 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD1O60671 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD1O60671 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD1O60671 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD1O60671 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD1O60671 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD1O60671 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD1O60671 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD1O60671 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD1O60671 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms