Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PPLO60437 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPLO60437 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPLO60437 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPLO60437 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PPLO60437 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PPLO60437 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PPLO60437 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PPLO60437 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPLO60437 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPLO60437 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PPLO60437 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PPLO60437 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PPLO60437 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PPLO60437 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PPLO60437 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPLO60437 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPLO60437 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PPLO60437 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PPLO60437 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPLO60437 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPLO60437 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PPLO60437 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PPLO60437 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PPLO60437 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PPLO60437 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PPLO60437 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PPLO60437 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PPLO60437 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PPLO60437 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PPLO60437 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PPLO60437 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPLO60437 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPLO60437 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPLO60437 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPLO60437 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PPLO60437 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPLO60437 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PPLO60437 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PPLO60437 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PPLO60437 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PPLO60437 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PPLO60437 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PPLO60437 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPLO60437 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPLO60437 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPLO60437 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PPLO60437 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPLO60437 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPLO60437 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPLO60437 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPLO60437 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PPLO60437 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PPLO60437 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PPLO60437 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PPLO60437 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPLO60437 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PPLO60437 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPLO60437 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PPLO60437 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PPLO60437 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms