Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRICKLE3O43900 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRICKLE3O43900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms