Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC28A2O43868 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC28A2O43868 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC28A2O43868 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC28A2O43868 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC28A2O43868 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC28A2O43868 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms