Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPOPO43791 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPOPO43791 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPOPO43791 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPOPO43791 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPOPO43791 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPOPO43791 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPOPO43791 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPOPO43791 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPOPO43791 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPOPO43791 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPOPO43791 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPOPO43791 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPOPO43791 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPOPO43791 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPOPO43791 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPOPO43791 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPOPO43791 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPOPO43791 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPOPO43791 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPOPO43791 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPOPO43791 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPOPO43791 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPOPO43791 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPOPO43791 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPOPO43791 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPOPO43791 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPOPO43791 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPOPO43791 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPOPO43791 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPOPO43791 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPOPO43791 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms