Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLX3O43711 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLX3O43711 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLX3O43711 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLX3O43711 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLX3O43711 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLX3O43711 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLX3O43711 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLX3O43711 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLX3O43711 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLX3O43711 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLX3O43711 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLX3O43711 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLX3O43711 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLX3O43711 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLX3O43711 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLX3O43711 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLX3O43711 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLX3O43711 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLX3O43711 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLX3O43711 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TLX3O43711 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLX3O43711 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLX3O43711 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLX3O43711 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLX3O43711 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLX3O43711 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLX3O43711 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLX3O43711 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLX3O43711 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLX3O43711 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLX3O43711 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLX3O43711 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLX3O43711 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms