Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSTPIP1O43586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSTPIP1O43586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSTPIP1O43586 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSTPIP1O43586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms