Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIPK2O43353 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIPK2O43353 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms