Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SART1O43290 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SART1O43290 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SART1O43290 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SART1O43290 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SART1O43290 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SART1O43290 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SART1O43290 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SART1O43290 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SART1O43290 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SART1O43290 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SART1O43290 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SART1O43290 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SART1O43290 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SART1O43290 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SART1O43290 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SART1O43290 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SART1O43290 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SART1O43290 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SART1O43290 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SART1O43290 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SART1O43290 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SART1O43290 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SART1O43290 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SART1O43290 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SART1O43290 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SART1O43290 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SART1O43290 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SART1O43290 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SART1O43290 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SART1O43290 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SART1O43290 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SART1O43290 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SART1O43290 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SART1O43290 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SART1O43290 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SART1O43290 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SART1O43290 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SART1O43290 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SART1O43290 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SART1O43290 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SART1O43290 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SART1O43290 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SART1O43290 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SART1O43290 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SART1O43290 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SART1O43290 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 389 ms