Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSC2O15499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSC2O15499 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSC2O15499 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSC2O15499 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSC2O15499 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSC2O15499 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSC2O15499 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSC2O15499 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSC2O15499 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSC2O15499 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSC2O15499 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GSC2O15499 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSC2O15499 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSC2O15499 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSC2O15499 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSC2O15499 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms