Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK1O15075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCLK1O15075 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCLK1O15075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms