Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCF2LO15068 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCF2LO15068 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCF2LO15068 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCF2LO15068 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms