Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PHOX2AO14813 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PHOX2AO14813 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms