Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SOCS3O14543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SOCS3O14543 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms