Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EBAG9O00559 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBAG9O00559 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms