Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1AO00322 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1AO00322 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms