Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN8O00124 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN8O00124 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms