Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms