Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
J3QR89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QR89 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QR89 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QR89 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QR89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
J3QR89 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
J3QR89 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QR89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
J3QR89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
J3QR89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
J3QR89 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QR89 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QR89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QR89 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QR89 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
J3QR89 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QR89 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QR89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QR89 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QR89 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms