Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8VWA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
F8VWA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
F8VWA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
F8VWA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
F8VWA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
F8VWA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
F8VWA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
F8VWA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
F8VWA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8VWA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
F8VWA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8VWA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8VWA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8VWA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
F8VWA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8VWA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8VWA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
F8VWA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
F8VWA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
F8VWA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
F8VWA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8VWA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8VWA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8VWA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8VWA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F8VWA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8VWA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8VWA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8VWA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8VWA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F8VWA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F8VWA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F8VWA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms