Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PROB1E7EW31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PROB1E7EW31 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PROB1E7EW31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1089.1 ms