Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B2RBV5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B2RBV5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B2RBV5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
B2RBV5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
B2RBV5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B2RBV5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B2RBV5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B2RBV5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B2RBV5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B2RBV5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B2RBV5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B2RBV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B2RBV5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B2RBV5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B2RBV5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B2RBV5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B2RBV5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B2RBV5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B2RBV5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B2RBV5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B2RBV5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
B2RBV5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B2RBV5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B2RBV5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B2RBV5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B2RBV5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B2RBV5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B2RBV5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B2RBV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B2RBV5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B2RBV5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B2RBV5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B2RBV5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B2RBV5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B2RBV5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B2RBV5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B2RBV5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B2RBV5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms