Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK7

CPSF4L, Putative cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4LA6NMK7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF4LA6NMK7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPSF4LA6NMK7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms