Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDR42E2A6NKP2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDR42E2A6NKP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDR42E2A6NKP2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms