Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC10BA6NIK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC10BA6NIK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC10BA6NIK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms