Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PSDA5PKW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PSDA5PKW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSDA5PKW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PSDA5PKW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms