Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMD3A2A2Y4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMD3A2A2Y4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMD3A2A2Y4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMD3A2A2Y4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms