Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM72A0PK05 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM72A0PK05 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM72A0PK05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM72A0PK05 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms