Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBA6A0AVT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA6A0AVT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA6A0AVT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms