Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A0U1RQF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A0U1RQF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms