Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A087X1B8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087X1B8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms