Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms