Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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