Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms