Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ABCG2Q9UNQ0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms